增值税发票抵扣联丢失是许多企业在日常经营中可能遇到的问题。这种情况可能会给企业带来一定的困扰，因为抵扣联的丢失意味着无法进行进项税额的抵扣，进而影响企业的财务状况。但是，这并不意味着企业就无法解决问题。以下是一些处理增值税发票抵扣联丢失问题的方法：

1. 尽快联系供应商

首先，企业应尽快与销售方取得联系，请求其提供一份加盖公章的记账联复印件或通过税务局认可的其他形式的复印件。这样既可以作为进项税额抵扣的凭证，也可以用于企业内部的财务管理。

2. 向主管税务机关报告

在某些情况下，如果上述方法不可行，企业需要及时向主管税务机关报告这一情况，并根据当地税务机关的具体要求提交相关证明材料。部分地区的税务机关可能会允许企业在满足一定条件的情况下继续进行进项税额的抵扣。

3. 保存好其他证明材料

除了尝试获取记账联复印件外，企业还应该妥善保管与该笔交易相关的其他文件和资料，如合同、银行付款凭证等。这些材料可以在日后作为进项税额抵扣的辅助证明，有助于税务机关审核。

4. 预防措施

为了避免未来再次发生类似情况，建议企业加强内部控制，比如采用电子发票系统来减少纸质发票丢失的风险；同时，对员工进行培训，提高他们对于重要财务文件管理的意识。

总之，虽然增值税发票抵扣联丢失会给企业带来一定的麻烦，但通过积极沟通和采取适当的补救措施，大多数情况下是可以解决这个问题的。同时，企业也应当从中吸取教训，采取有效措施防止类似事件再次发生。