奥迪A3两厢和三厢车型在维修成本上的差异通常并不显著，因为它们共享了许多相同的零部件和机械结构。以下是一些影响维修成本的关键因素：

1. 零部件通用性：两厢和三厢版本的奥迪A3通常使用相同的发动机、变速箱和其他主要部件。这意味着如果需要更换这些部件，两者的价格通常是相同的。

2. 保养周期：两厢和三厢车型的保养周期和维护要求基本一致。定期更换机油、滤清器等常规保养项目的费用也相差不大。

3. 保险费用：虽然两厢和三厢车型的外观不同，但它们的保险费用可能因其他因素（如驾驶记录、地区差异等）而有所不同，而不是直接由车身类型决定。

4. 维修复杂性：从维修的角度来看，两厢车由于后备箱空间较小，某些维修工作可能会更方便进行，但这并不会对整体维修成本产生重大影响。

5. 市场因素：维修成本也可能受到当地市场供应情况的影响。例如，某些地区的零部件价格可能会略有差异。

综上所述，奥迪A3两厢和三厢的维修成本差异通常很小，具体成本还取决于车辆的具体年份、行驶里程以及具体的维修项目。如果你关心维修成本，建议咨询当地的奥迪经销商或维修店以获取更准确的信息。